《农产品质量安全监管专项经费管理暂行办法》讲解了加强农产品质量安全监管的专项经费使用规则及监督管理要求，明确了农业部门预算中用于确保农产品（包括农业投入品）质量安全的专项资金管理流程。文件描述了经费主要用于开展农产品和农业投入品质量监测、风险评估与预警、监督抽查、农资打假以及相关法律法规制定和技术规范推行等多个方面。该办法规定，农产品质量安全监管经费由农业部实施项目化管理，并明确列出资金可支持的方向如农产品质量安全监测和认证，农业投入品质量监管，转基因生物安全执法，制度建设等方面。对于具体的申报和执行，文档指出由农业部制定工作计划，承担单位根据计划制定实施方案并逐级审批下达资金。在经费管理上，则要求设立明细账确保专款专用，年度项目结束需进行总结报告提交，同时规定项目承担单位需定期自我检查和接受重点抽查，省级主管部门要做好监督协调。对于违规行为，如提交虚假材料、擅自变更方案或挪用经费等均提出处理方式。
《农产品质量安全监管专项经费管理暂行办法》适用于全国范围内涉及农产品质量安全的各级农业主管部门及其下属事业单位，也涵盖参与项目的科研教学机构、学会（协会）和其他有关社会组织或企业。该办法主要应用于农产品及农业投入品质量监管领域，旨在规范经费的申报与使用，提升资金效益。具体行业涵盖种植业、种子业、畜牧业、兽药业、渔业以及农垦领域，涉及到这些行业中农产品和投入品质量安全相关的监测、评估、认证及宣传培训活动。
