番茄品种鉴定 SNP分子标记法NYT4493-2025.pdf

《番茄品种鉴定SNP分子标记法》讲解了利用单核苷酸多态性（SNP）技术对番茄品种进行DNA分子水平鉴定的技术规范，《番茄品种鉴定SNP分子标记法》描述了从样品准备、DNA提取、PCR扩增、荧光原位扫描到结果判定的完整操作流程。该文件明确了适用于番茄（Solanum lycopersicum L.）品种鉴定的术语定义、缩略语、技术原理及关键试剂与仪器要求。其核心技术基于SNP位点的遗传稳定性，通过检测不同品种在特定SNP位点上的等位变异差异实现品种区分。推荐采用KASP（竞争性等位基因特异性PCR）技术结合荧光原位扫描系统进行高通量、高精度的基因分型。标准规定了DNA提取的CTAB方法及质量控制指标，要求O D260/O D280比值在1.8至2.0之间，确保后续扩增有效性。PCR反应体系和程序根据微孔板或微量反应孔膜平台进行了细化，并强调设置空白对照和参照样品以保证检测可靠性。引物信息详见附录C，支持序贯检测策略，即一旦发现足以区分的差异位点即可终止检测，提高效率。参照品种用于辅助判读等位变异状态，应与待测样品同步分析。数据分析阶段需记录各SNP位点的基因型，如AA、TT等形式，缺失数据标为“—”，并统计比对结果中的总检测位点数和差异位点数。最终判定标准为：差异位点数大于0时判定为“不同”，等于0时判定为“疑同”，并以标准化格式表述结果。本文件还引用了GB/T 扦样规程和实验室用水标准，确保检测全过程的规范性与可重复性。

《番茄品种鉴定SNP分子标记法》适用于从事番茄种质资源管理、品种权保护、种子质量监管、新品种审定与登记的相关科研机构、检测实验室及种子企业技术人员。该标准为农业行政管理部门、植物新品种保护机构、第三方检测单位在开展番茄品种真实性鉴定和DUS测试辅助分析时提供科学依据和技术支撑。同时适用于育种单位在品种选育过程中进行遗传背景分析与纯度检测，以及高校和科研院所从事作物分子标记研究的教学与科研工作。凡涉及番茄DNA分子数据采集、基因型比对、品种身份构建与鉴别等工作的领域均可参照执行，尤其适合需要高通量、高准确率分子鉴定技术的应用场景。